MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 1574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008118	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793733
2	NC_008118	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793733
3	NC_008118	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793733
4	NC_008118	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	108793733
5	NC_008118	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	108793733
6	NC_008118	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	108793733
7	NC_008118	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108793733
8	NC_008118	GTTCG	2	10	426	435	0 %	40 %	40 %	20 %	108793733
9	NC_008118	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793733
10	NC_008118	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793733
11	NC_008118	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793733
12	NC_008118	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	108793733
13	NC_008118	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	108793733
14	NC_008118	AAGGT	2	10	775	784	40 %	20 %	40 %	0 %	108793733
15	NC_008118	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	108793733
16	NC_008118	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793733
17	NC_008118	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	108793733
18	NC_008118	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793733
19	NC_008118	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793733
20	NC_008118	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793733
21	NC_008118	AGCGC	2	10	1175	1184	20 %	0 %	40 %	40 %	108793734
22	NC_008118	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793734
23	NC_008118	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793734
24	NC_008118	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793734
25	NC_008118	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	108793734
26	NC_008118	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793734
27	NC_008118	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793734
28	NC_008118	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	108793734
29	NC_008118	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793734
30	NC_008118	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793734
31	NC_008118	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	108793734
32	NC_008118	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793734
33	NC_008118	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793734
34	NC_008118	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793734
35	NC_008118	TCAAA	2	10	1813	1822	60 %	20 %	0 %	20 %	108793734
36	NC_008118	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	108793734
37	NC_008118	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	108793735
38	NC_008118	TCT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
39	NC_008118	TCA	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793735
40	NC_008118	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793735
41	NC_008118	TTC	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
42	NC_008118	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
43	NC_008118	CTT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
44	NC_008118	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	108793735
45	NC_008118	GAT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793735
46	NC_008118	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793735
47	NC_008118	GTC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793735
48	NC_008118	GGT	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793735
49	NC_008118	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	108793735
50	NC_008118	CAG	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793735
51	NC_008118	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793736
52	NC_008118	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	108793736
53	NC_008118	TGAG	2	8	3064	3071	25 %	25 %	50 %	0 %	108793736
54	NC_008118	CAG	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
55	NC_008118	ACT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
56	NC_008118	CTG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
57	NC_008118	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	108793736
58	NC_008118	TGT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793736
59	NC_008118	GGTT	2	8	3400	3407	0 %	50 %	50 %	0 %	108793736
60	NC_008118	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
61	NC_008118	ATC	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
62	NC_008118	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	108793736
63	NC_008118	GCC	2	6	3554	3559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793736
64	NC_008118	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	108793736
65	NC_008118	ATG	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793736
66	NC_008118	GGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793736
67	NC_008118	ACT	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
68	NC_008118	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	108793736
69	NC_008118	AAC	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
70	NC_008118	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793736
71	NC_008118	CTG	2	6	3882	3887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
72	NC_008118	ACC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793736
73	NC_008118	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793736
74	NC_008118	AGCC	2	8	4173	4180	25 %	0 %	25 %	50 %	108793736
75	NC_008118	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
76	NC_008118	TCCA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	0 %	50 %	108793736
77	NC_008118	GCT	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
78	NC_008118	GCA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
79	NC_008118	CAA	2	6	4374	4379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
80	NC_008118	CAG	3	9	4428	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
81	NC_008118	CTAT	2	8	4481	4488	25 %	50 %	0 %	25 %	108793736
82	NC_008118	ACT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
83	NC_008118	AAC	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793736
84	NC_008118	CTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
85	NC_008118	GTT	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793736
86	NC_008118	TGC	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
87	NC_008118	CCG	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793736
88	NC_008118	GCT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
89	NC_008118	AGC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
90	NC_008118	CAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
91	NC_008118	GCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793736
92	NC_008118	AGC	4	12	5002	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
93	NC_008118	GAA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793736
94	NC_008118	GCA	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
95	NC_008118	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108793736
96	NC_008118	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	108793736
97	NC_008118	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793736
98	NC_008118	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793736
99	NC_008118	TGA	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793736
100	NC_008118	CTTC	2	8	5613	5620	0 %	50 %	0 %	50 %	108793736
101	NC_008118	TTG	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793736
102	NC_008118	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108793736
103	NC_008118	CCG	2	6	5904	5909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793737
104	NC_008118	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	108793737
105	NC_008118	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	108793737
106	NC_008118	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	108793737
107	NC_008118	TCGT	2	8	5997	6004	0 %	50 %	25 %	25 %	108793737
108	NC_008118	AAC	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793737
109	NC_008118	TTA	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793737
110	NC_008118	AGA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793737
111	NC_008118	GCT	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793737
112	NC_008118	ATTA	2	8	6246	6253	50 %	50 %	0 %	0 %	108793737
113	NC_008118	ACC	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793737
114	NC_008118	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793737
115	NC_008118	ATA	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793737
116	NC_008118	TTCA	2	8	6566	6573	25 %	50 %	0 %	25 %	108793738
117	NC_008118	TAA	2	6	6648	6653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793738
118	NC_008118	GATT	2	8	6666	6673	25 %	50 %	25 %	0 %	108793738
119	NC_008118	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	108793738
120	NC_008118	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	108793738
121	NC_008118	CTG	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
122	NC_008118	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793738
123	NC_008118	TAG	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793738
124	NC_008118	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
125	NC_008118	GCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
126	NC_008118	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
127	NC_008118	CTGC	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	108793738
128	NC_008118	CTGC	2	8	7189	7196	0 %	25 %	25 %	50 %	108793738
129	NC_008118	CGC	2	6	7261	7266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793738
130	NC_008118	GCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
131	NC_008118	CTT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793738
132	NC_008118	TGC	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793738
133	NC_008118	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	108793738
134	NC_008118	AGC	2	6	7445	7450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793738
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150	NC_008118	TGTT	2	8	8550	8557	0 %	75 %	25 %	0 %	108793738
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155	NC_008118	GTG	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793738
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158	NC_008118	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	108793738
159	NC_008118	GGC	2	6	8940	8945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793738
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161	NC_008118	GTT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793738
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251	NC_008118	CCA	2	6	14876	14881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793743
252	NC_008118	TGA	2	6	15026	15031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793743
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256	NC_008118	ATC	2	6	15151	15156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793743
257	NC_008118	TGA	2	6	15164	15169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793743
258	NC_008118	TGG	2	6	15209	15214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793743
259	NC_008118	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	108793743
260	NC_008118	GCCG	2	8	15309	15316	0 %	0 %	50 %	50 %	108793743
261	NC_008118	CTTC	2	8	15338	15345	0 %	50 %	0 %	50 %	108793743
262	NC_008118	GCT	3	9	15394	15402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
263	NC_008118	GCG	2	6	15430	15435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793743
264	NC_008118	GCA	2	6	15442	15447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793743
265	NC_008118	TCG	2	6	15454	15459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
266	NC_008118	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	108793743
267	NC_008118	GAT	2	6	15531	15536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793743
268	NC_008118	GCC	2	6	15640	15645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793743
269	NC_008118	GTC	2	6	15652	15657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
270	NC_008118	CGC	2	6	15708	15713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793743
271	NC_008118	TGC	2	6	15785	15790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
272	NC_008118	TTC	2	6	15826	15831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793743
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275	NC_008118	TCG	2	6	15976	15981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
276	NC_008118	GTC	2	6	15996	16001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
277	NC_008118	CCT	2	6	16028	16033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793743
278	NC_008118	AGA	2	6	16058	16063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793743
279	NC_008118	CTT	2	6	16106	16111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793743
280	NC_008118	GTT	2	6	16159	16164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793743
281	NC_008118	TTC	2	6	16186	16191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793743
282	NC_008118	CAA	2	6	16202	16207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793743
283	NC_008118	AGT	3	9	16250	16258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793743
284	NC_008118	CTG	2	6	16284	16289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793743
285	NC_008118	GCC	2	6	16348	16353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793743
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288	NC_008118	AGCC	2	8	16779	16786	25 %	0 %	25 %	50 %	108793743
289	NC_008118	CGAA	2	8	16847	16854	50 %	0 %	25 %	25 %	108793743
290	NC_008118	ATG	2	6	16873	16878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793743
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292	NC_008118	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	108793743
293	NC_008118	AGG	2	6	16955	16960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793743
294	NC_008118	CAT	2	6	16995	17000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793743
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296	NC_008118	CGCA	2	8	17025	17032	25 %	0 %	25 %	50 %	108793743
297	NC_008118	TTC	2	6	17178	17183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793743
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300	NC_008118	GCA	2	6	17227	17232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793743
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302	NC_008118	CCA	2	6	17276	17281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793743
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332	NC_008118	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	108793746
333	NC_008118	CAGT	2	8	19219	19226	25 %	25 %	25 %	25 %	108793746
334	NC_008118	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	108793746
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339	NC_008118	TCT	2	6	19518	19523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793746
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348	NC_008118	AACC	2	8	19948	19955	50 %	0 %	0 %	50 %	108793747
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352	NC_008118	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	108793748
353	NC_008118	GATA	2	8	20388	20395	50 %	25 %	25 %	0 %	108793748
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363	NC_008118	CAGA	2	8	21268	21275	50 %	0 %	25 %	25 %	108793750
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368	NC_008118	CGA	2	6	21856	21861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793750
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371	NC_008118	GTC	2	6	22195	22200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793751
372	NC_008118	GCT	2	6	22219	22224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793751
373	NC_008118	GCT	2	6	22290	22295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793751
374	NC_008118	TTC	3	9	22410	22418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793751
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376	NC_008118	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	108793752
377	NC_008118	TGAA	2	8	22791	22798	50 %	25 %	25 %	0 %	108793828
378	NC_008118	ACGG	2	8	22856	22863	25 %	0 %	50 %	25 %	108793828
379	NC_008118	AAGC	2	8	22910	22917	50 %	0 %	25 %	25 %	108793828
380	NC_008118	GAT	2	6	22923	22928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793828
381	NC_008118	CTG	2	6	22930	22935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793828
382	NC_008118	GCTC	2	8	22938	22945	0 %	25 %	25 %	50 %	108793828
383	NC_008118	CGGCA	2	10	22977	22986	20 %	0 %	40 %	40 %	108793828
384	NC_008118	GCG	2	6	23143	23148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793753
385	NC_008118	AG	3	6	23173	23178	50 %	0 %	50 %	0 %	108793753
386	NC_008118	CAA	2	6	23237	23242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793753
387	NC_008118	CGC	2	6	23258	23263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793753
388	NC_008118	GCAG	2	8	23300	23307	25 %	0 %	50 %	25 %	108793753
389	NC_008118	TGCT	2	8	23312	23319	0 %	50 %	25 %	25 %	108793753
390	NC_008118	GGC	2	6	23384	23389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793753
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393	NC_008118	CAT	2	6	23472	23477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793753
394	NC_008118	TCG	2	6	23518	23523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793753
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